藻类水华在澳大利亚水域中很常见，会对水质造成显著影响。水华通常发生在温暖的月份，此时有害藻类的生长可能优于无害藻类。炎热干燥的环境会导致水流缓慢或缺乏湍流，从而促进藻类生长。人类活动（包括农业活动和污水排放）产生的氮、磷等营养物质也会加剧水华的发生。
藻类水华会在水面形成一层通常呈绿色或红褐色的浮渣，并常常散发出异味。随着藻类的大量繁殖，其他藻类和植物会死亡腐烂。细菌对这些有机物的分解会降低水体中的氧气含量，导致水体停滞，进而造成鱼类死亡。
藻类水华的难看外观和恶臭会阻止人们进入可能受到污染的水道。某些藻类，例如蓝藻（或蓝细菌），会在水中产生毒素，这些毒素会损害肝脏或神经系统，从而对人类和野生动物的健康造成不利影响。摄入这些毒素可能导致腹泻、恶心、头痛和痉挛等症状。在新南威尔士州，曾有报道称，一些狗在受污染的水道中游泳后死亡，原因是吞咽水或舔舐皮毛上的藻类时摄入了毒素。尸检显示，严重的肝损伤是导致死亡的原因。蓝藻水华并非总是有毒的，但目前尚不清楚是什么因素会引发这些藻类释放毒素。
藻类水华经常发生在用于提供饮用水的供水水库中，这尤其引起水务部门的关注。
藻类会干扰水处理过程，它们会堵塞用于去除原水中悬浮物的过滤器。通常需要安装活性炭过滤器等处理系统来消除任何潜在的毒素。用于游泳或划船等休闲活动的蓄水池或水道中的藻华也需要被识别，以确保公众了解藻华情况并被警告不要使用该水体。应尽可能将牲畜和其他动物与该水体隔离。
因此，藻华监测是水质监测计划的重要组成部分。水样采集于可阻挡光线的塑料瓶中，并用卢戈氏碘液保存。藻类学家通过显微镜分析藻类，以识别特定的藻类种类。这是一个劳动密集型过程，识别和计数特定水样中的所有藻类可能需要一个多小时。如果检测到大量蓝藻，对样品进行化学分析，以确定是否存在该特定有毒藻类产生的毒素。
Symbio Laboratories 提供合适的藻类采集样品瓶，并拥有一支由藻类学家和化学家组成的团队，负责藻类种类和毒素的计数和鉴定。