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概述
基于基因型的鉴定
Symbio 提供全基因组测序 (WGS) 和靶向基因组测序 (TGS) 服务,以实现对微生物的准确、全面的检测。这些基因型分析,也称为高通量测序 (HTS) 或下一代测序 (NGS),与传统方法相比具有诸多优势,并可同时并行测序多个 DNA 分子。
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细节
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微生物多样性分析:
微生物多样性分析是指对特定区域(例如 16S 核糖体 DNA (rDNA) 和内部转录间隔区 (ITS))进行 16S/ITS 扩增子测序,用于鉴定和比较给定样本中存在的细菌或真菌。16S 是样本中原核生物(即细菌)最常用的标记基因,而 ITS 区域则用作宏基因组样本中真菌物种的 DNA 标记。该方法能够对复杂且混合的微生物群落进行属级鉴定。
该技术无需培养微生物,是分析样本中整个微生物群落的有效方法。与传统方法相比,每次测序运行可合并多个样本,从而具有无可比拟的效率。
全基因组测序(WGS):
全基因组测序(WGS)分析可对食品和环境病原体进行鉴定和表征,一次运行即可揭示生物体的完整DNA组成,从而有助于了解物种内部和物种之间的变异。该技术还有助于追踪微生物的来源,尤其是在食源性疾病或疫情暴发期间。
基于蛋白质组学的鉴定:
基质辅助激光解吸/电离 (MALDI) 飞行时间 (TOF) 质谱是一种基于蛋白质组学的技术,可快速、准确、可靠地鉴定微生物。该技术取代了传统的、费时费力的方法,可在检测到阳性微生物分离株后数分钟内确认和鉴定微生物。
该方法可鉴定多种细菌和真菌,包括沙门氏菌属、李斯特菌属、单核细胞增生李斯特菌、弯曲杆菌属和阪崎肠杆菌属等食源性致病菌。
该系统还可鉴定肠杆菌科、产孢细菌、酵母和霉菌等食品腐败或质量指标至属或种水平。
该方法通过更快地确认初步结果,显著缩短了所有微生物分析的周转时间 (TAT)。